Una de las tareas de la Salud pública es el control de las enfermedades transmisibles en la Comunidad Autónoma Vasca. Aunque la mejora de las condiciones de vida y el desarrollo alcanzado por el sistema sanitario vasco han reducido el impacto de muchas enfermedades infecciosas, éstas continúan representando un importante problema de salud.

Además de enfermedades como la tuberculosis, cuyo impacto se reduce cada año, o el sarampión, en vías de desaparición, otras enfermedades, las llamadas enfermedades emergentes, aparecen periódicamente y hacen imprescindible mantener una vigilancia epidemiológica adecuada. El propósito del Sistema de Vigilancia Epidemiológica es proporcionar información rápida y fiable, que posibilite acciones destinadas al control y a la prevención de las enfermedades transmisibles y brotes en la CAV.