Para el buen desarrollo de las evaluaciones se necesitan establecer métodos de trabajo adecuados y explícitos. Asimismo, para la correcta interpretación de los productos de la evaluación de tecnologías sanitarias, al igual que en otras disciplinas, se hace necesario tener conocimientos básicos del procedimiento y la metodología común a los mismos.

Por ello, Osteba viene publicando documentos metodológicos de apoyo y organiza y coordina una serie de actividades de formación con el fin de transmitir el espíritu y utilidad de la evaluación de los procedimientos y propagar la "mentalidad evaluadora" basada en la evidencia científica. De este modo se trataría de evitar la variabilidad de práctica médica injustificada y eliminar procedimientos o actuaciones sin efectividad demostrada.

Los cursos se realizan a demanda de los centros sanitarios, de profesionales o de sociedades científicas. Los temas abordados tienen relación directa con la actividad de evaluación de tecnologías sanitarias: búsquedas de información, evaluación de la evidencia científica, revisiones sistemáticas de la literatura y evaluación económica.

Durante los años 2000 a 2002 se realizaron mas de 30 cursos o seminarios que totalizaron unas 500 horas docentes, con una participación de mas de 1.500 profesionales del sistema sanitario vasco. En el año 2003, además se han realizado, en el marco del proyecto europeo de diseminación del Instrumento AGREE, 16 talleres formativos en el País Vasco y en otras Comunidades Autónomas, lo que ha supuesto una asistencia de 320 personas en 9 localidades diferentes. Esta actividad, acreditada por ha sido posible gracias a la colaboración de la Fundación Biblioteca Josep Laporte y de las Agencias de Evaluación de de Tecnologías Sanitarias del estado.